SMARTなら、まだディスクアクセスはできるでしょ？
物理的に逝ってるかどうかは、Raid Controller のログ送ってくれたら見てあげるよ。
消えてるデータがあるのなら、データ領域にMedia Error（=不良ブロック）が出て、Read時に拾ってSMART吐いてるんだと思うけどね。いずれにしてもさっさとデータBackupして交換したほうが吉（出来れば生きてる片割れも）。

駄目元で、ログをテキストに吐く設定にして/f chkdsk掛けてみな。壊れたファイル名分かる事があるし、Indexが見えないだけなら復旧できる可能性あるから。

あぼーんした状況としてはとあるディレクトリ配下が丸ごと見られなくなったのがコトの発覚。
それ以外のところのファイルは何個かコピー出来なかったものもあったけどばっくうｐ成功。

んで、拾える分だけ拾ったからってリブートふっかけたら起動時にchkdskが作動したんよ。
ものはついでだ～と思ってやったらドライブ丸々吹っ飛んじまったｗｗｗｗ

ログは残ってないけど、indexの不一致以外に
Deleting corrupt file record segment xxxx.
Deleting orphan file record segment xxxx.
みたいなのがボコボコ出てたのでデータ領域も吹っ飛んでたんだと思う。
（↑おそらく見られなくなったディレクトリ配下じゃねえかなと）

んで、取りあえずエラーが発生したHDDのフォーマットが出来たので
もう一回RAID再構築したらエラー発生して怒られた。多分うよの言うとおり
SMARTのステータス的につかえねーよｳﾞｧｰｶって感じかと。

うーん。HDDは新調しないとだめだぬ。

×Deleting
○Deleted
だったかもしれん。